Ergün Atalay, 1954 yılında Adapazarı’nda doğdu. 1967 yılında Donatım İlkokulundan mezun oldu. 1968 yılında TCDD Çıraklık Okuluna girdi ve buradan 1972 yılında mezun oldu. Tıpkı yıl Adapazarı Vagon Fabrikasında işbaşı yaptı.
1978 yılında TÜVASAŞ işyeri sendika temsilciliğine getirildi. 1982 yılında yapılan seçimlerde Demiryol-İş Sendikası Adapazarı Şube Mali Sekreterliğine ve 1992 yılında ise Şube Başkanlığına seçildi. Demiryol-İş Sendikası Denetim Kurulu üyeliği yaptı.
1999 yılında Demiryol-İş Sendikası 6. Olağan Genel Heyetinde Genel Başkanlığa seçildi. 2003, 2007, 2011 ve 2015’de bu misyona tekrar seçildi. Aralık 2002’de yedekten girdiği TÜRK-İŞ İdare Kurulu’nda Genel Eğitim Sekreterliği misyonuna getirildi.
19, 20 ve 21. Olağan Genel Heyetlerde Genel Mali Sekreterlik vazifesine seçildi.
3-6 Aralık 2015 ve 5-7 Aralık 2019 tarihlerinde gerçekleştirilen TÜRK-İŞ 22 ve 23’üncü Olağan Genel Konseylerinde ise Genel Başkanlık misyonuna tekrar seçilmiştir.
Atalay, evli ve üç çocuk babasıdır.